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      細(xì)菌16S rDNA菌種鑒定

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      菌種鑒定有多種方法,而通過DNA測序鑒定的方法被譽為金標(biāo)準(zhǔn)。DNA 測序進(jìn)行菌種鑒定的結(jié)果比傳統(tǒng)生化鑒定更為直接,鑒定結(jié)果也更為可靠。核糖體RNA(rRNA)是生物細(xì)胞中主要的核糖核酸之一。rRNA分子的一級結(jié)構(gòu)既具有高度保守性區(qū)域,又具有高度變化特異性區(qū)域。保守區(qū)域反映了生物物種間的親緣關(guān)系,可用于構(gòu)建生命統(tǒng)一進(jìn)化樹,而高度變化特異區(qū)域則能表明物種間的差異,可用于區(qū)別屬或者種。


      細(xì)菌具有5S, 16S, 23S三種rRNA,其中5S rRNA序列較短,包含的細(xì)菌遺傳信息量少,不適合用于分析鑒定細(xì)菌種類,而23S rRNA序列較長,且堿基突變速率要比16S rRNA快得多,不適用對較遠(yuǎn)親緣關(guān)系的細(xì)菌進(jìn)行鑒定。16S rRNA其大小約1500 bp ,所代表的細(xì)菌遺傳信息量適中,是進(jìn)行細(xì)菌分類研究的理想材料。


      細(xì)菌16S rDNA是細(xì)菌染色體上編碼16S rRNA的DNA序列,存在于所有細(xì)菌染色體基因中,它由保守區(qū)序列及可變區(qū)序列兩部分組成。細(xì)菌16S rDNA的可變區(qū)序列能夠顯示細(xì)菌間不同分類等級水平上的特異性,適用于進(jìn)化距離不同的各類生物親緣關(guān)系的研究,并可作為測量細(xì)菌進(jìn)化和親緣關(guān)系的良好工具,同時可以利用可變區(qū)序列的差異對不同菌屬、菌種的細(xì)菌進(jìn)行分類鑒定。

      服務(wù)內(nèi)容:
      提取客戶提供的細(xì)菌菌株基因組總DNA,擴增細(xì)菌16S rDNA序列,對細(xì)菌16S rDNA序列進(jìn)行序列測定,分析細(xì)菌16S rDNA序列信息,確定客戶樣品細(xì)菌種屬關(guān)系。

      您需要提供的信息:
      1) 試管菌、甘油菌、體積大于500ul的細(xì)菌菌液或細(xì)菌DNA。
      2) 所送樣品可能的分類地位、已知生長性狀、分離環(huán)境條件、所提供的DNA純度等。
      3) 細(xì)菌樣品是否具有致病性和潛在危險,如您對樣品具有一定的致病性或均有潛在的危險,請您提供細(xì)菌DNA。

      服務(wù)價格:
      1) 細(xì)菌16S rDNA部分序列分析:300元/樣品
      2) 細(xì)菌16S rDNA全序列分析:500元/樣品

      服務(wù)周期:
      30樣品以下10-15個工作日內(nèi)遞交結(jié)果。如遇到特殊情況,我們會及時與您聯(lián)系,保證盡早發(fā)貨。
      30樣品以上依據(jù)具體樣品數(shù)量而定。

      服務(wù)承諾:
      我們提供給您細(xì)菌樣品的測序鋒圖,序列比對結(jié)果及完整的結(jié)果分析報告。

      客戶須知:
      1) 我們的一次性收費包括細(xì)菌DNA提取,細(xì)菌16S rDNA 序列擴增,擴增產(chǎn)物純化及16S rDNA序列測序費用。
      2) 細(xì)菌鑒定服務(wù)完成后相應(yīng)的菌株為您保存1個月,一月后將統(tǒng)一銷毀。
      3) 常溫運輸時間過長會導(dǎo)致菌體老化,細(xì)胞壁難以破碎,因此對于試管菌,建議您使用冰袋運輸。
      4) 如果測序結(jié)果出現(xiàn)套峰,視為樣品不純,因?qū)嶒灅悠凡患冊斐傻臏y序套峰,將收取全額實驗費用。
      5) 我們不接受有致病性菌種的鑒定。
      Genenode|君諾德公司

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