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      5-RACE & 3-RACE服務(wù)

      RACE (rapid-amplification of cDNA ends),即cDNA末端快速克隆技術(shù)。RACE基于PCR技術(shù)基礎(chǔ)之上,先由RT-PCR從RNA中獲取cDNA片段,再通過設(shè)計引物與PCR向兩端延伸擴(kuò)增從而獲得完整的3’端或5’端序列,是一種從低豐度的轉(zhuǎn)錄本中快速擴(kuò)增cDNA的5’和3’末端的有效方法。相比于其他獲得新基因的方法,RACE原理簡單、無需建立文庫、快速廉價,正受到越來越多科研工作者的重視。

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      技術(shù)原理:RACE (rapid-amplification of cDNA ends),即cDNA末端快速克隆技術(shù)。RACE基于PCR技術(shù)基礎(chǔ)之上,先由RT-PCR從RNA中獲取cDNA片段,再通過設(shè)計引物與PCR向兩端延伸擴(kuò)增從而獲得完整的3'端或5'端序列,是一種從低豐度的轉(zhuǎn)錄本中快速擴(kuò)增cDNA的5'和3’末端的有效方法。相比于其他獲得新基因的方法,RACE原理簡單、無需建立文庫、快速廉價,正受到越來越多科研工作者的重視。


      3'末端RACE:
      利用mRNA的3'末端的poly(A)尾巴作為一個引物結(jié)合位點,以連有SMART寡核苷酸序列通用接頭引物的Oligo(dT)30MN作為鎖定引物反轉(zhuǎn)錄合成標(biāo)準(zhǔn)第一鏈cDNA。然后用一個基因特異引物作為上游引物,用一個含有部分接頭序列的通用引物作為下游引物,以cDNA第一鏈為模板,進(jìn)行PCR循環(huán),把目的基因3' 末端的DNA片段擴(kuò)增出來。


      5'末端RACE:
      利用一條基因特異性反轉(zhuǎn)錄引物,在反轉(zhuǎn)錄酶的作用下合成cDNA第一鏈,將RNA-DNA雜合鏈中的RNA降解純化后,利用末端轉(zhuǎn)移酶在cDNA鏈的3’端加入PolyC尾巴,然后利用錨定引物和一條基因特異性引物擴(kuò)增。

      實驗步驟:
      1. 總RNA的提?。何覀儗⑹褂肨RIzol法來提取實驗材料的總RNA,這一步可由您自己完成。
      2. cDNA的合成與檢測:反轉(zhuǎn)錄生成cDNA的第一鏈,再生成cDNA第二鏈,電泳檢測cDNA的產(chǎn)量。
      3. RACE 擴(kuò)增:我們使用錨定PCR(AnchoredPCR)與巢式PCR(Nested PCR)相結(jié)合的方法,用試劑盒分別進(jìn)行3'末端和5'末端RACE。
      4. RACE產(chǎn)物檢測測序:將RACE產(chǎn)物TA克隆并進(jìn)行測序。

      客戶需要提供:
      實驗樣品:
      提取Total RNA的材料:動植物組織,細(xì)胞或菌液(保證材料充足),液氮或干冰運輸;

      或者由您直接提供總RNA: 3’RACE:Total RNA>15μg; 5’RACE:Total RNA>25μg。


      序列信息:
      大于200bp的已知序列(請注明已知序列的5’端及3’端):如果已知序列比較短,建議先進(jìn)行3’RACE再進(jìn)行5’RACE,以提高實驗的成功率;
      實驗數(shù)據(jù)和參考文獻(xiàn):這將會幫助我們更好地理解您的實驗背景,有利于實驗的順利進(jìn)行。
       
      實驗將得到的結(jié)果:
      實驗報告:引物信息實驗過程 PCR產(chǎn)物照片;
      測序結(jié)果:測序彩色波形圖、測序方向圖、堿基序列圖;
      實驗產(chǎn)物:引物、測序用質(zhì)粒(限產(chǎn)生克隆測序的情況)。
       
      服務(wù)說明:
      1. 請保證材料或者總RNA新鮮,如果基因的含量較低或者未知序列較長,樣品量需相應(yīng)增加;
      2. 我們會根據(jù)已知序列進(jìn)行特異性擴(kuò)增,如果得不到目的序列或為非目的基因的序列,我們將停止實驗并收取實驗成本費用;如果得到序列與您提供的序列有個別堿基不符,我們在征求您的意見后決定是否進(jìn)行RACE實驗;
      3. 我們將設(shè)計跨內(nèi)含子引物PCR檢驗基因表達(dá)水平,如果經(jīng)驗證,樣品中基因表達(dá)含量低時,我們將與您溝通后,決定下一步實驗使用的方法;

      4. 對于原核生物RNA我們僅進(jìn)行5'RACE。


      實驗周期及收費標(biāo)準(zhǔn):

      服務(wù)項目
      基礎(chǔ)費用(500bp以內(nèi))
      超過部分
      周期(工作日)
      3'RACE技術(shù)服務(wù)
      3800元
      2元/bp
      15-20工作日
      5'RACE技術(shù)服務(wù)
      4800元
      5元/1bp
      15-20工作日
      上述收費標(biāo)準(zhǔn)是針對正?;颍瑢τ诨蚝康陀谡5臉悠?,我們會使用特殊的方法,具體情況請與技術(shù)人員溝通協(xié)商。
      服務(wù)說明:
      1、如果您的樣品為原核生物,我們無法保證序列為3'端或5'端全長。
      2、由于mRNA存在個體和組織差異,PCR產(chǎn)物測序或許會有套峰存在,此種情況之下我們會提供2個克隆的測序結(jié)果,由客戶最終確認(rèn)其準(zhǔn)確性。

      Genenode|君諾德公司

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